砂の惑星アラキスを巡って宇宙の覇権を賭けた戦いが勃発。ハルコンネン家の陰謀によってアトレイデス家は全滅するが、後継者のポールは生き延びていた。最愛の父と人生のすべてを失った彼は砂漠の民チャニと心を通わせ、その絆はポールを救世主としての運命に導いてゆく。一方、ハルコンネン家は宇宙を統べる皇帝と手を組み、その力を増していた。やがて迎えた復讐の時、ポールは宇宙の命運を決める最終決戦へと挑むのだが…。